Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
RASSF1Q9NS23 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASSF1Q9NS23 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
RASSF1Q9NS23 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms