Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HELLSQ9NRZ9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms