Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SERINC1Q9NRX5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms