Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX15Q9NRS6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX15Q9NRS6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms