Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DUOX2Q9NRD8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
DUOX2Q9NRD8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms