Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CASS4Q9NQ75 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CASS4Q9NQ75 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms