Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ABCB9Q9NP78 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ABCB9Q9NP78 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms