Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP62

GCM1, Chorion-specific transcription factor GCMa, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM1Q9NP62 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GCM1Q9NP62 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GCM1Q9NP62 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms