Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3GQ9HC16 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms