Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC4Q9H6D8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FNDC4Q9H6D8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms