Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDGFDQ9GZP0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDGFDQ9GZP0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms