Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EDEM3Q9BZQ6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EDEM3Q9BZQ6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms