Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SMIM3Q9BZL3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms