Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
MAP1LC3CQ9BXW4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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