Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SNHG12Q9BXW3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms