Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VN1R3Q9BXE9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VN1R3Q9BXE9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms