Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAIPQ9BWF2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAIPQ9BWF2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms