Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
HIRIP3Q9BW71 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms