Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MCMBPQ9BTE3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms