Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC39A3Q9BRY0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms