Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SIKE1Q9BRV8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SIKE1Q9BRV8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms