Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SRSF8Q9BRL6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SRSF8Q9BRL6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms