Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CMSS1Q9BQ75 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms