Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPOCK3Q9BQ16 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SPOCK3Q9BQ16 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms