Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP88Q99567 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP88Q99567 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms