Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CRBNQ96SW2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CRBNQ96SW2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms