Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DCLRE1CQ96SD1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms