Protein–RNA interactions for Protein: Q96S52

PIGS, GPI transamidase component PIG-S, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIGSQ96S52 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIGSQ96S52 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIGSQ96S52 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIGSQ96S52 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIGSQ96S52 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms