Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CICQ96RK0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CICQ96RK0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms