Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GCNAQ96QF7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GCNAQ96QF7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms