Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ALS2Q96Q42 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ALS2Q96Q42 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms