Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms