Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RDH12Q96NR8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms