Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFAP53Q96M91 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP53Q96M91 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms