Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALPK3Q96L96 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALPK3Q96L96 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms