Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00208Q96KT6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms