Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MS4A4AQ96JQ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MS4A4AQ96JQ5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms