Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
EAF1Q96JC9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EAF1Q96JC9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms