Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC34Q96HJ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms