Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LTV1Q96GA3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LTV1Q96GA3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms