Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BICD1Q96G01 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BICD1Q96G01 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms