Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC97Q96F63 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC97Q96F63 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms