Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHFRQ96EP1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms