Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
MTERF3Q96E29 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms