Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCTD12Q96CX2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCTD12Q96CX2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCTD12Q96CX2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCTD12Q96CX2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCTD12Q96CX2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCTD12Q96CX2 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
KCTD12Q96CX2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCTD12Q96CX2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCTD12Q96CX2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCTD12Q96CX2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms