Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GCC1Q96CN9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GCC1Q96CN9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms