Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NSUN4Q96CB9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NSUN4Q96CB9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms