Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C6Q969F1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C6Q969F1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
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