Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PRG4Q92954 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRG4Q92954 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms