Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ERCC4Q92889 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms